核心概念：测序技术平台
在了解品牌前,先简单了解主流的测序技术，因为它们决定了仪器的核心性能：
- 第二代测序技术：目前市场绝对主流，特点是高通量、低成本，可以同时对数百万至数十亿条DNA分子进行测序，读长较短（通常为50-300 bp），但可以非常精确地测定基因组中所有位置的序列，非常适合全基因组测序、转录组测序、外显子组测序等。
- 第三代测序技术：新兴技术，特点是长读长（可达数十万bp），能够直接读取DNA序列，无需PCR扩增，因此可以检测到一些二代技术难以发现的复杂结构变异，但通量相对较低，单碱基成本较高，非常适合填补基因组组装中的“空白区域”、检测重复序列区域、甲基化分析等。
- 一代测序技术：以Sanger法为代表，特点是读长长、准确率高，但通量极低、成本高，目前主要用于小片段（如PCR产物、克隆验证）的测序。
第二代测序仪 主流品牌及价格
这是目前绝大多数实验室和商业测序服务公司使用的平台。
Illumina (因美纳) - 市场绝对领导者
Illumina的SBS（边合成边测序）技术是NGS的“金标准”，市场份额超过80%，其产品线覆盖了从入门到旗舰的各种需求。
| 仪器型号 | 技术平台 | 主要特点 | 通量 | 参考价格 (人民币) | 适用场景 |
|---|---|---|---|---|---|
| iSeq 100 | SBS | 入门级，桌面式，操作简单，无需专业实验室，通量低。 | ~7.5 Gb/run | 约 40 - 60 万 | 教学、小规模靶向测序、验证实验 |
| NextSeq 550/550dx | SBS | 中端，内置计算机，可进行即时测序，通量适中，灵活性高。 | 120 - 400 Gb/run | 约 150 - 250 万 | 转录组、外显子组、靶向 panel，临床诊断 |
| NovaSeq 6000 | SBS | 旗舰级，模块化设计，通量极高，是目前全球测序产能的主力。 | 6 - 200 Tb/run | 约 600 - 1200 万+ (根据配置) | 大规模人群基因组计划、大型科研项目、商业测序中心 |
| MiniSeq | SBS | 小型化，通量较低，但比iSeq高，适合特定实验室。 | 5 - 25 Gb/run | 约 80 - 120 万 | 靶向测序、基因表达、小规模外显子组 |
Illumina的优势在于生态系统完善、试剂稳定、数据产出量大且标准化，缺点是仪器和试剂成本高昂，且专利壁垒较高。
MGI Tech (华大智造) - 强有力的挑战者
作为Illumina的主要竞争对手,MGI凭借其独有的DNBSEQ™技术（一种基于DNA纳米球的桥式扩增和测序技术）迅速崛起，以“平价、高通量”为策略抢占市场。
| 仪器型号 | 技术平台 | 主要特点 | 通量 | 参考价格 (人民币) | 适用场景 |
|---|---|---|---|---|---|
| MGISEQ-2000 | DNBSEQ | 中高端，双芯片设计，通量高，成本显著低于Illumina同级别产品。 | 60 - 100 Gb/run | 约 200 - 300 万 | 大规模科研项目、肿瘤多组学、人群队列研究 |
| MGISEQ-T7 | DNBSEQ | 旗舰级，四芯片设计，是目前全球通量最高的NGS平台之一，性价比极高。 | 1 - 6 Tb/run | 约 400 - 600 万 | 大规模基因组计划、超大规模测序项目 |
| MGISEQ-20 | DNBSEQ | 入门级，桌面式，小巧灵活，适合小实验室。 | 4 - 1 Gb/run | 约 30 - 50 万 | 科研入门、靶向测序、微生物鉴定 |
MGI的优势在于价格优势明显、通量提升快、本土化服务好，缺点是品牌历史相对较短，全球市场份额和生态系统仍在建设中。
Thermo Fisher Scientific (赛默飞世尔)
赛默飞通过收购Ion Torrent公司，拥有其独特的半导体测序技术。
| 仪器型号 | 技术平台 | 主要特点 | 通量 | 参考价格 (人民币) | 适用场景 |
|---|---|---|---|---|---|
| Ion GeneStudio S5 Series | 半导体测序 | 操作快速，无需光学系统，检测的是pH变化，读长短，但速度快。 | 15 M - 80 M reads/run | 约 100 - 250 万 | 靶向测序、HLA分型、病原体快速鉴定、临床应用 |
Ion Torrent的优势在于速度快、设备维护相对简单，缺点是读长短、错误率在同源区域较高，不适合需要长读长或高精度的项目。
第三代测序仪 品牌及价格
第三代测序仪在特定应用领域不可替代,是前沿研究的利器。
Pacific Biosciences (PacBio) - SMRT测序技术
以超长读长著称，是填补基因组“暗物质”的关键工具。
| 仪器型号 | 技术平台 | 主要特点 | 通量 | 参考价格 (人民币) | 适用场景 |
|---|---|---|---|---|---|
| Revio | SMRT Cell | 新一代旗舰，通量相比Sequel II/IIe有数量级提升，成本大幅降低，实现长读长测序的平民化。 | ~100 Gb (30x Hg38) | 约 500 - 700 万 | 完整基因组组装、复杂结构变异检测、全长转录组测序 |
| Sequel IIe / II | SMRT Cell | 经典长读长平台，在Revio推出前是行业标准，依然在许多实验室使用。 | 8 - 30 Gb/run | 约 400 - 600 万 (已逐渐被Revio替代) | 同上，尤其适用于需要极高读长质量的精细研究 |
PacBio的核心优势是超长读长和直接测序检测甲基化，缺点是原始测序准确率略低（通常需要通过HiFi Circular Consensus Sequencing技术来提高），且单碱基成本远高于NGS。
Oxford Nanopore Technologies (ONT) - 纳孔测序技术
以其真正的便携式设备和超长读长闻名，甚至可以进行实时测序。
| 仪器型号 | 技术平台 | 主要特点 | 通量 | 参考价格 (人民币) | 适用场景 |
|---|---|---|---|---|---|
| PromethION | 纳孔 | 高通量台式机，由多个可独立更换的Flow Cell组成，通量极高，可扩展性强。 | 100 Gb - 20 Tb+/run | 约 300 - 600 万 (主机) + 每个Flow Cell数万 | 大规模长读长基因组、环境宏基因组、实时病原体监测 |
| MinION | 纳孔 | USB大小的便携式设备，是“口袋测序仪”，可连接电脑直接测序，通量低但灵活性极高。 | 5 - 30 Gb/run | 约 3 - 5 万 (设备) + Flow Cell | 现场快速检测、野外考察、教学、快速验证 |
ONT的优势在于便携、实时、超长读长、直接检测修饰碱基，缺点是原始测序准确率相对较低（最新技术已有显著提升），且数据分析相对复杂。
一代测序仪 (Sanger法) 品牌
虽然不再是主流,但在很多实验室仍是必备工具。
| 品牌/型号 | 特点 | 参考价格 (人民币) |
|---|---|---|
| ABI 3500/3730xl系列 (赛默飞) | 行业标准，自动化程度高，通量高（相比传统Sanger），数据准确可靠。 | 约 20 - 50 万 (取决于配置和通量) |
| 其他国产品牌 | 如通用生物、天根等，提供性价比更高的选择。 | 约 5 - 15 万 |
总结与选购建议
| 品牌 | 核心优势 | 典型型号 | 价格区间 (人民币) | 适合谁？ |
|---|---|---|---|---|
| Illumina | 生态完善、数据量大、标准化 | iSeq, NextSeq, NovaSeq | 40万 - 1200万+ | 预算充足，追求稳定可靠，需要处理海量数据的科研机构或商业中心。 |
| MGI Tech | 性价比高、通量强大、价格优势 | MGISEQ-20, T7 | 30万 - 600万 | 追求高性价比，希望以较低成本获得高通量数据的实验室，特别是国内用户。 |
| PacBio | 超长读长、检测甲基化 | Revio | 500万 - 700万 | 需要进行高质量基因组组装、研究复杂变异或全长转录组的顶尖研究机构。 |
| ONT | 便携、实时、超长读长 | MinION, PromethION | 3万 - 600万+ | 需要现场快速检测、实时分析，或研究超长DNA/RNA结构的实验室。 |
| 赛默飞 (Ion Torrent) | 速度快、操作简单 | Ion S5 | 100万 - 250万 | 需要快速完成靶向测序、临床检测等项目的实验室。 |
| Sanger测序仪 | 准确、读长、小片段验证 | ABI 3500/3730 | 5万 - 50万 | 几乎所有生物实验室，用于小片段验证、克隆鉴定等常规工作。 |
如何选择？
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明确应用：
- 全基因组测序/重测序：Illumina NovaSeq/MGI T7 (短读长) + PacBio/ONT (长读长，用于填补空缺) 是黄金组合。
- 转录组测序：Illumina NextSeq/MGI (mRNA-seq) 或 PacBio/ONT (全长转录组)。
- 靶向测序/Panel：Illumina iSeq/NextSeq, MGI MGISEQ-20, Ion S5 都非常合适。
- 临床诊断：注重法规认证和稳定性，Illumina NextSeq 550dx和Ion S5是主流选择。
- 快速病原体鉴定：ONT MinION 或 Ion Torrent。
- 教学/小验证：Illumina iSeq, MGI MGISEQ-20, 或 Sanger测序仪。
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评估预算：不仅要考虑仪器本身的购买成本，还要长期考虑试剂耗材和维保费用，Illumina和MGI的耗材是持续性的主要支出。
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考虑通量：预计每周/每月需要多少样本？每个样本需要多少数据量？这直接决定了你需要选择哪个通量级别的仪器。
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评估配套能力：
- 湿实验：是否有空间、人员和SOP来建库、上机测序？
- 干实验：是否有强大的计算服务器和生物信息学分析人员来处理海量数据？
希望这份详细的梳理能帮助您更好地了解DNA测序仪市场！
