在单细胞研究领域,建库试剂盒是决定实验成败的关键试剂之一，其质量直接影响单细胞捕获效率、文库均一性、基因检出率等核心指标，目前市场上主流的单细胞建库试剂盒品牌各具特色，技术路线涵盖基于微流控的液滴捕获（如10x Genomics）、基于磁珠的细胞分离（如Takara）以及基于平板捕获的方案（如BD），用户需根据实验需求、样本类型及预算进行选择，以下从技术原理、核心优势、适用场景等维度对各品牌试剂盒进行详细解析。
10x Genomics的Chromium系列试剂盒是该领域的标杆产品，其基于微流控技术的微滴分区（Drop-on-Demand）原理，可实现高通量单细胞捕获（一次实验可处理数千至数万个细胞），其核心优势在于独特的GEMs（凝胶珠乳液）技术，将凝胶珠、细胞和酶统一包裹在微滴中，实现高通量逆转录和文库构建，基因检出率高（通常可达10000-20000基因/细胞），且3’基因表达、5’基因表达、免疫组库、空间转录组等多组学试剂盒兼容性强，适用于新鲜或冷冻细胞悬液、组织解离样本，在肿瘤、神经科学、发育生物学等领域应用广泛，但仪器和试剂盒成本较高，且对操作环境要求严格。
Takara（宝生物）的单细胞试剂盒以高性价比和灵活性见长，其Smart-seq2和Smart-seq HT系列基于传统微量建库技术，通过优化逆转录和扩增步骤，可实现低细胞数（甚至单细胞）的高灵敏度检测，基因检出率可达15000-25000基因/细胞，适合低丰度转录本检测或稀有细胞类型研究，Takara的试剂盒兼容普通PCR仪和自动化工作站，无需特殊设备，降低了入门门槛，尤其适用于中小型实验室，但其通量相对较低（一次处理几十至几百个细胞），不适合大规模样本筛查。
BD（Becton Dickinson）的Rhapsody™系列试剂盒结合了磁珠分选和微孔板捕获技术，通过磁珠标记细胞表面抗原，实现基于免疫表型的单细胞分选，同时进行转录组测序，该试剂盒支持多重标记（可同时检测细胞表面蛋白和mRNA），适用于免疫细胞异质性研究、肿瘤微环境分析等场景，其优势在于分选精度高，可富集特定细胞亚群，且自动化程度高（搭配BD Rhapsody™分析仪），但成本介于10x和Takara之间，且对样本解离质量要求较高。
其他品牌中,Illumina的Bio-Tek系列试剂盒基于Nextera®标签技术，适用于单细胞ATAC-seq和ChIP-seq表观遗传学研究，其转座酶标签效率高，建库速度快；Thermo Fisher Scientific的™IVD级单细胞试剂盒（如Ambion®）则侧重于临床应用，符合体外诊断试剂规范，适用于液体活检等场景。
以下为部分主流单细胞建库试剂盒品牌性能对比：
| 品牌 | 技术路线 | 通量（细胞/次） | 基因检出率（基因/细胞） | 核心优势 | 适用场景 |
|---|---|---|---|---|---|
| 10x Genomics | 微流控微滴捕获 | 1000-100000 | 10000-20000 | 高通量、多组学兼容 | 大规模转录组、空间转录组 |
| Takara | 微量建库 | 10-1000 | 15000-25000 | 高灵敏度、低成本、无需特殊设备 | 稀有细胞、低丰度转录本研究 |
| BD | 磁珠分选+微孔 | 100-10000 | 12000-18000 | 免疫分选+转录组联合分析 | 免疫异质性、肿瘤微环境 |
| Illumina | 转座酶标签 | 1000-50000 | -（适用于表观遗传） | ATAC-seq/ChIP-seq建库效率高 | 表观遗传机制研究 |
选择试剂盒时需综合考虑样本类型（如血液、组织、细胞系）、实验目的（如常规转录组、免疫组库、空间定位）、通量需求及预算，若需进行大规模肿瘤细胞亚群筛查，10x Genomics是首选；若研究稀有干细胞或低表达基因，Takara的Smart-seq2更具优势；若需结合表面蛋白和转录组分析，BD的Rhapsody™系列更合适。
相关问答FAQs
Q1：单细胞建库试剂盒的选择是否需要考虑物种兼容性？
A1：是的，不同品牌的试剂盒对物种的兼容性存在差异，10x Genomics的3’和5’试剂盒主要适用于人、小鼠、大鼠等模式生物，对非模式生物（如鱼类、植物）可能需要定制化方案；而Takara的Smart-seq2试剂盒通过优化引物设计，可兼容更广泛的物种，甚至部分原核生物，若研究非模式生物，建议优先选择物种验证数据较多的品牌，或咨询厂商提供定制服务。
Q2：单细胞建库试剂盒的保存条件和有效期如何？
A2：大多数单细胞建库试剂盒需在-20℃或-80℃低温保存，部分酶组分（如逆转录酶）需避光保存，不同品牌试剂盒的有效期通常为12-24个月，具体需参考产品说明书，10x Genomics的Chromium试剂盒需在-20℃保存，且避免反复冻融；Takara的试剂盒中，Master Mix组分需分装保存以降低冻融次数，使用前需检查试剂是否有沉淀、变色等异常情况，确保实验稳定性。
